正因为有古文献功底，湖南省中医药研究所开办硕士研究生班时，缺一位高级讲师主讲《医古文》和《中医文献学》课程，段毅飞被推荐去担任讲师。因家学渊源和治学严谨，凭着过硬的古文功底和中医药文献研究方面的深厚积淀，他的讲课受到了学生的一致好评。
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从2014年9月起，段毅飞在《中国中医药报》刊发了系列文章。文章引经据典，以深邃的思考、透彻的理解，阐述了“中医大道”“上医治国”的深意，一时在行业内外引发积极反响，既帮助中医药从业者全面深度理解中医，运用中医思维发展中医，又使行业外领导干部加深对中医的了解。自1988年起，他一直参与省市中医药事业发展规划等调研、起草、论证工作，为中医药改革发展建言献策。
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