一些全身性疾病也会导致咽喉免疫力降低，从而感染慢性咽炎。
比如贫血、消化不良、胃食管反流、心脏病、慢性支气管炎、支气管哮喘、风湿病、肝肾疾病等，都有可能引发慢性咽炎。
另外内分泌紊乱、自主神经失调、臭鼻杆菌及类白喉杆菌感染、维生素缺乏及免疫功能紊乱等，均与萎缩性及干燥性咽炎有关。
五：过敏因素
吸入性过敏原，包括季节性和常年性过敏原，都有可能引发过敏性咽炎。另外一些药物，或者工作环境中的化学刺激物，也都会引发过敏性咽炎。
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