这座始建于康熙年间的寺庙，由于当时高原上地广人稀，而且蒙古族又是一个游牧民族，信息与各方面的技术都相对滞后。相对于当时的环境，那时的僧人们就是最有学问的人，他们上知天文，下通地理。所以五当召是一个功能齐全的寺庙。既是弘扬佛法的寺庙，敬佛，讲经，布道，接待朝奉者；又是一座高原上的学校，传法，辩经。学习医学，天文，数学，大地测量等缜密学问。并以知识分类为四大学部，各部都有自己的学习区域。各个大殿的用途基本上是按此分类。
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