但不管怎么说，这项技术的研发充满着巨大争议。主要的顾虑在于少量人类干细胞可能会发生迁移并进入猪胚胎发育中的大脑，从而赋予后者一部分人类性状。但罗斯博士坚称：“我们认为产生一个人类大脑的可能性非常低，但我们将严肃研究这一问题。”
不过面对这样的进展，美国政府监管当局仍然显得非常谨慎，坚持要求这一胚胎在第四周之前必须去除，以便对其细胞结构进行检验。
明尼苏达大学的沃尔特·洛（Walter Low） 教授也正在开展着一项类似的项目，其表示猪是一种理想的“生物孵化器”。他说：“比如说，利用这种方法在猪的体内培育的肝脏将是你原先肝脏的完美拷贝，只 是更加年轻且更加健康的版本。因此你在接受相关移植手术之后完全不需要服用任何免疫抑制的药物，要知道这些药都是有副作用的。”
洛教授也承认，人类细胞向猪脑补的扩散将是一个值得关注的地方，但他也表示：“每培育一个器官，我们都会仔细观察猪脑部的变化，如果我们发现后者变得越来越像人类大脑，那我们就不会允许这一胚胎继续发育。”
但运动组织“生殖道德评论”的约瑟夫·奎塔瓦力（Josephine Quintavalle）表示：“这类实验是对人类尊严的极大冒犯，任何应用方面的说辞也无法帮助绕开这一点。我们对于相关人士的傲慢与自负感到震惊。”
纽约医药学院的斯图尔特·纽曼（Stuart Newman）教授表示：“这样做是在闯入一个令人不安的领域，我认为这有损我们对于‘人性’的感知。”而英国“善待动物组织”（PETA）的茱莉亚·拜恩斯（Julia Baines）则对这项研究提出了谴责，她称之为“弗兰肯斯坦式的科学”，并认为这样的研究“将产生人畜杂交的胚胎，这对于人类是一件坏事，而对于动物来说则更加糟糕。”（晨风）
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