忽必烈将贵由前来的目的告诉刘秉忠等人，他让额吉不要多想，刘秉忠清楚最有望继承大汗的人是蒙哥和忽必烈。蒙哥宴请将领，他清楚宽容对手的能力。贵由背着脱列格那召开阔里台大会推举大汗，他指责她的做法就是自欺欺人，霍赤的话让贵由更加明白他们的用意。
在贵由的努力下阔里台大会召开，脱列格那被众人指责，王爷们已经商量过让脱列格那让位，将权力交给有能力的大汗，众人议论纷纷，蒙哥的才能被人认可。忽必烈突然起身推举贵由为新任大汗，众人吃惊不已，大断事官提醒贴尼王妃，她赞成忽必烈的意见，贵由上台接任蒙古大汗之位。会后蒙哥指责忽必烈支持贵由，忽必烈解释其中原因，贴尼劝说蒙哥，蒙哥生气出账。
贵由召开会议将拖雷家的兵权交给还忽必烈的兄弟们，他希望他们回去后好好治理自己管辖的地方。忽必烈和兄弟们返回驻地，公元1246年，贵由面对他母亲留下的烂摊子，实行了铁腕改革，海迷失也借此机会清除脱列哥那留下的爪牙，他们先除掉那些凭借脱列哥那的权势陷害忠良、搜刮民财、胡做非为的官员，一夜之间那些官员纷纷被捕，朝野震动。此外，贵由大汗重用前朝重臣镇海，整肃吏治，这一系列铁腕改革使汉廷重新焕发生机。
宫女向脱列格那汇报贵由的改革措施，霍赤也被禁止进入汗宫，海迷失派人继续监视脱列格那。脱列格那在海迷失面前大发厥词，海迷失已不再是以前的宫女，她想让脱列格那过一些清闲的日子。拨都的兄弟昔班知道贵由的能力，拨都跟本看不上贵由，忽必烈和昔班、阔端三人结为兄弟，贵由来时被昔班奚落，昔班还骂贵由是自以为是的昏君，他是代表拨都而来。忽必烈劝开昔班和贵由，贵由和昔班打起来，阔端拉开劝架的忽必烈，贵由挨打后生气回到汗宫。
海迷失听贵由说起昔班的情况后准备给他一小教训，昔班走时被兵马追赶，他不敌众人被擒获。忽必烈收到情况后赶回去见到被关押的昔班，他让昔班向贵由道歉，昔班坚持不同意。贵由不听忽必烈的劝说，他在酒后命人将囚犯全部处决，等贵由清醒时才意识到问题的严重性。忽必烈找贵由说起杀昔班的后果很严重，贵由以喝醉为由进行推托，幸好忽必烈用死囚换了昔班，贵由同意让他将昔班带走。刘秉忠建议忽必烈招贤纳才，忽必烈让他去办。
忽必烈传奇第20集剧情介绍忽必烈得知察比有身孕后欣喜万分，终日形影不离，察比也自小产后有了幸福的表情，两人度过了一段平静的日子。忽必烈广招人才，他从刘秉忠眼里看出担忧，刘秉忠提出将那些草场改为耕地，忽必烈让刘秉忠办理草场和耕地的比例分配，他要摸索出一条蒙汗相融的好办法。海云大师来到邢州后见到贴尼，他在途中听说近来又增添了不少纷乱。
海云大师相信忽必烈日后大有作为，刘秉忠也愿意追随忽必烈做更多的事情。察比产期已至，忽必烈在屋外听焦急地等待，当他听到婴儿的哭声后慌忙赶过去，忽必烈提议让海云大师为儿子取名，海云大师为他起名真金。刘秉忠帮云林将皮毛拿给察比，陈附马和五公主来到邢州，他们夸奖忽必烈的治理方法。
察比见父母来后很高兴，陈附马和五公主看到外孙后十分欣喜，忽必烈的妹妹劝贴尼为忽必烈纳侧妃，五公主听到后十分生气。阿里不哥和旭烈兀来到邢州向忽必烈学习治理之策，三人一同去见贴尼。蒙古在贵由的治理下商贸繁荣、百姓安居乐业，同时海迷失又为贵由生了一个儿子，一切看上去都很幸福。
拨都停止向和林上贡的消息让贵由十分生气，贵由自有打算，海迷失劝他不要和拨都开战，贵由不听。察比无意中看到力气很大的库撒儿，她用破弓弦做成的衣服箭都射不穿。阿里不哥不明白汉人为何要建造都城，刘秉忠为他解释原因，阿里不哥巡视期间喜欢上库撒儿，她的马技和射箭都十分了得。
阿里不哥回去后打听库撒儿的下落，结果在察比府中找到，他向察比说明喜欢一个女孩儿，但不敢直接表白，察比给他出主意让他扮成普通老百姓去接近库撒儿。阿里不哥换了一身装束来到库撒儿家中，他在过路人名义向库撒儿父亲讨水喝，还坐下来拉起家常，老人家让库撒儿给阿里不可准备吃的东西。烈必烈收到贵由的召唤后马上赶往汗宫，海迷失劝说贵由，她知道拨都的实力，海迷失提出围猎的办法。
忽必烈传奇第21集剧情介绍忽必烈来到汉宫，贵由说明和拨都开战之意，忽必烈知道他还是因为昔班的事情，贵由坚持要清理门户，他希望忽必烈等自己出兵时相助，忽必烈难以从命。毒蛇惊吓到库撒儿家的马群，阿里不哥看到后急忙去套头马，库撒儿在追赶时从马上摔下受伤，阿里不哥骑马带她回去，库撒儿对他套住头马表示感谢。贴尼向阿里不哥问起库撒儿，他还不知道库撒儿的心思。
阿里不哥来到草场帮库撒儿放马，库撒儿给他做衣服表示感谢。云林见刘秉忠夜里还在看公文，她端着夜宵送去，还问起他走仕途的原因，那素面是她特意做的，云林已对他产生好感。库撒儿做衣服时有些为难，阿里不哥进门后吓她一跳，库撒儿将做好的披风让阿里不哥试穿，他穿上之后感觉很不合适，不过心里很幸福。
忽必烈将忧虑告诉贴尼，察比也劝他千万不要出兵。郝沁在邢州王府门口要见忽必烈时被卫兵阻拦，她只好在街上想办法见到忽必烈，她说明哥哥郝经的情况后忽必烈派刘秉忠去套牢查看，刘秉忠在忽必烈面前推荐郝经。董文用和董文忠向忽必烈等人说起郝经喜欢呆在牢里，郝经的脾气有些古怪，忽必烈亲自来到牢中看望郝经，郝经听说妹妹的情况后并不在意，忽必烈请他出山相助，郝经没有回复。
库撒儿已经有心上人，阿里不巴对她有好感，只是两人都缺少勇气表白。察比知道郝经是个人才，她让忽必烈再去牢房中请他出山。贵由派人送信给拨都，海迷失劝他冷静一些。拨都看完信后十分恼火，贵由让他们按时上供，否则就安造反论处，拨都命军队进入战备状态。
忽必烈找阿里不哥说起贵由起兵之事，他已收到和林送来的信件，阿里不哥之后也收到和林的来信。库撒儿知道阿里不哥要走时前去送行，他将随身的小刀送给她，库撒儿将做好的披风送给他。贵由向蒙哥、阿里不哥和旭烈兀商量攻打拨都之事，他们有些惊讶，贵由提出和拨都交战时让他们两不相帮。
