爱连莲胜过爱自己的茅剑升，恼恨黑帮绑架连莲，救走连莲后在格杀黑帮的过程中身负枪伤。连莲发现多年来一直默默无闻的茅剑升居然是个能为自己豁出性命的人，再加上连城的冷淡，使她对茅剑升的感情发生了变化。
茅剑升坏了道上规矩，令冷长礼很是恼火，但他最担心的还是连莲移情，他知道茅剑升不过是个走狗，但连莲不可自拔，无奈之下冷长礼只好暂时不予追究茅剑升。冷长礼找到连城，向他请罪。连城不明所以，冷长礼说自己决不允许茅剑升对连莲有非分之想，这次他滥杀无辜必将严惩
。连城正欲说情，忽然接到命令：委员长召见。离开冷长礼，连城感到背后发凉，他发现冷长礼对自己的了解甚至超过自己，这意味着他所做的一切都有可能被识破，他暗自告诫自己不可大意，今后做事要更加慎重。
河南豫东爆发天灾，戴笠却将报道此事的《大公报》记者拘捕，并查封了报馆。此举引发百姓不满，蒋介石召见连城询问此事，连城据实回答，蒋介石遂下令拨发救灾款项。蒋介石对连城这种敢言实话真话的性格愈发欣赏。
冷长礼下令不准连莲探望茅剑升，连莲气愤的找冷长礼理论，冷长礼告诉连莲她如果要爱一个男人，只能是连城。唐爱诗终于决定信任连城，她要帮助连城进一步取得蒋介石的信任和欢心，第一步便是学会用西餐的礼仪，因为蒋夫人宋美龄最喜欢西化的人士……
深度潜伏第17集剧情介绍中统内部有人找到茅剑升，要想脱罪只能说谎，将陈老太说成是日伪特务，茅剑升为了脱罪，开始编织谎言。连莲与冷长礼打起了冷战，冷长礼最后妥协，他可以放了茅剑升，但条件是，连莲必须尽可能少的见他。连莲不置可否。蒋介石委连城协调共产党等各方关系之重任，连城也因此得以名正言顺的与一些共产党人士来往，并可以自由出入八路军办事处。这让多年来一直想跟共产党取得联系的连城兴奋不已。
共产党正在大规模整风，韩奎因复杂的身世背景和从军经历受到了严格的审查，甚至将他与连城在台儿庄战场上的事也拿来审问，韩奎不胜其烦，却强压怒气一一解释，然而结果却还是将韩奎定性为敌特，这让韩奎无法接受。按捺不住的韩奎出言讥讽，更被视为狂妄自大，必须严厉打击。
焦急的红缨去找苏志丹帮忙，苏志丹了解情况后，费尽力气才保全韩奎。历经坎坷，红缨对韩奎的感情，苏志丹一目了然，但韩奎却矢口否认。连城与唐爱诗在交往中也是一日千里，从起初的拘束到后来的熟悉，两个人的内心也在悄悄发生着变化。
连城与负责联络国民党的八路军代表处高主任畅谈国际局势，认为战争早已扩大成一场世界大战，国共两党若能精诚合作，击败日寇计日可待。高主任问连城，国共合作的几率有多大?连城思索片刻，叹了口气说，愿望虽好可有人不愿意，老蒋跟冯玉祥、李宗仁、白崇禧都闹不和，更别提是跟共产党合作了。
深度潜伏第18集剧情介绍高主任和连城相谈甚欢，高主任欢迎连城经常过来坐坐。连城询问自己算不算共产党员，高主任转达周恩来的指示，说连城是特殊时期的特殊党员，既然已经取得了国民党众多派系的信任，就应该继续发挥更大的作用。他要连城记住，生存就是胜利。连城问怎么跟党联系?高主任说，需要联系时，党会去找你。
连莲去找连城时，无意中发现了唐爱诗，将这个情况告诉了冷长礼。冷长礼琢磨此事可能与连城有关，他对连城多少有些怀疑。然而碍于此时连城的身份地位，不可能派特务去监视，只好派出心腹管家彭久，小心调查，寻找证据。连城一直与唐爱诗兄妹相称，掩人耳目。但连城觉得这样不是长久之计，决定两人以情侣身份共处。为了不让连莲破坏自己的计划，冷长礼只好让茅剑升回到连莲身边，让他牵制住连莲。
一场国民党高级将领的酒会上，连城再次遇见了马军长，马军长对连城夸个没完，可是临了却突然打听唐爱诗的情况，这引起了连城的警惕，他明白，周围已经有人开始盯上自己了。连莲提出要嫁给茅剑升，被冷长礼拒绝，连莲问原因，冷长礼说，很简单，茅剑升不配做我的女婿。
1945年，抗战胜利。随后，内战不可避免的爆发。9月，蒋介石亲自委派连城前往广州担任最高行政长官，成为第四十六军军长兼管海南警备司令部。而韩奎与红缨也一并分到了海南纵队。
