黎征农向郑云帆说起，那天晚上没有对他下手的刺客就是武藏樱子，同时他问起，刚刚他跟武藏樱子都谈了什么?杀手一直跟着樱子，却被樱子杀掉。郑云帆告诉黎征农，要么他把自己抓起来杀掉，要么什么都不要说，同时他承诺自己一定会破解蓝密的。三天后郑云帆打电话告诉陈长官，蓝密译电被自己破解了。陈长官召集了大家，说起郑云帆破解蓝密的事情。泰勒听此感到十分的吃惊。郑云帆向大家念起了此次侦破的译文，泰勒决定马上向白宫报告此事，建议下令伏击山田五十郞。
毛主任告诉黎征农，取消密裁郑云帆的计划，不过他无论如何都得加入军统局。4月18日上午7时许，大日本帝国联合舰队司令长官山田五十郞大将乘坐壹式轰炸机巡视南太平洋前线，突遭16架美军P-38歼击机急袭，长官座机坠毁于原始森林，山田长官头部胸部中弹身亡。
将军对武藏大发脾气，武藏自责是自己判断失误，因为只有他可以破解蓝密。将军得知幻影郑云帆是武藏的学生时，不禁十分的吃惊。武藏因为自责而自杀。久井对樱子大发脾气，并将电文拿给她看。得知因为自己的私情放走了郑云帆，害死了自己的父亲，樱子不禁想要自杀，久井上前阻止。
毛主任叫来了郑云帆，给了他勋章，并告诉他从今天起他就是军统局少校军衔。郑云帆直言，自己只听从陈长官的命令。毛主任说军统局和译电处将要合并，郑云帆听后请求辞职，毛主任却拒绝，并说他永远也不可能成为普通的老百姓了，之后他让黎征农帮郑云帆办理入职手续。久井要求樱子在12个小时之内除掉参与破译蓝密的工作人员，樱子说为了给父亲报仇，所以自己一定会除掉那些人，久井却说她的目标就是除掉幻影，因为今晚他会跟自己在文峰寺见面。
小高回家休息，被樱子拿绳子勒死。黎征农看到一美女独自坐在那里，于是便上前聊了起来。黄特务他们开车不停的寻找黎征农，因为毛主任大发脾气，所以他们认定肯定是出大事了。黄特务在酒吧找到了黎征家，正当他们打算坐车离开的的时候，樱子朝他们开枪。玉洁在那里猜测，联想起樱父就是蓝密的创造者，而因为译电科破译了蓝密，所以导致武藏切腹自杀，因而他们要复仇。
毛主任得知黎征农也遭到暗杀。玉洁他们猜测出郑云帆是日方要刺杀的首个对象。郑云帆去找了胡先生，他说自己不想在那家公司干了，胡先生质问是不是想离开重庆?郑云帆说起自己想出去谋个教职，可是他现在还没有想清楚。小兰接到了建勋的电话，得知日本人要刺杀郑云帆，她想要去帮忙，可是建勋说她现在处于特殊时期，所以不能轻举妄动。因为一直都找不到郑云帆，毛主任十分着急，下令千万不能让郑云帆落到日本人的手里。
幻影第12集剧情介绍盆景王告诉黎征农，郑云帆已经离开。因为前面有三条岔路，所以黎征农说现在只有赌一把了。小兰匆匆的追上了郑云帆，此时久井向他们开枪，小兰一把将郑云帆推开，自己则不幸中枪。黎征农他们听见了枪声也赶过去帮忙，小兰让郑云帆赶紧走，这时樱子上前阻止。郑云帆被击中，小兰向樱子开枪，这时久井再次向小兰开枪。建勋赶了过来，久井却绑小兰当人质。小兰自杀，建勋愤怒的向久井开枪。小兰死在了建勋的怀里，建勋伤心欲绝。第二天樱子拖着受伤的身体回去。
郑云帆躺在抢救室里昏迷不醒，耿建勋向护士许苗苗打听郑云帆的情况。樱子扮作护士去了医院，毛主任走出来说起，真可惜他就这样殉国了，同时他命秘书去通知报社，表扬他对党国的忠诚。樱子听到了这些不禁十分的伤心。许苗苗向建勋说起，那个伤员死了。见有人来了，许苗苗安排建勋从后面逃跑。黎征农向许苗苗问起，这屋子就她一个人吗?许苗苗确认，黎征农离开。
老刘和建勋玉洁他们三人祭奠小兰同志，老刘说起，玉洁将调往八路军进击鲁豫军区，明天就动身离开重庆。樱子伤心的走在路上，她站在海边，想起了跟郑云帆在一起的日子。船夫看到樱子站在那里，担心她会出什么事情。大梁得知有一位姑娘想要寻死，匆匆的和船夫赶了过去。樱子脱掉了外套，一步一步的往前走，她决定随爸爸一起去。大梁他们到了海边却发现人已经不见了。许苗苗跑去海边质问爸爸找到人了没有?大梁二人觉得人不会有事，所以便带着苗苗离开。
毛主任告诉受重伤的郑云帆，泰勒将军跟他一起去美国治疗，同时交待他不能跟家里的人联系。黄贵说郑云帆这次可是因祸得福，毛主任却说天上不会掉馅饼，不过他还是希望郑云帆跟美国人合作，早日研制出高级的军事密码。因为抗战就要胜利了，他们势必要与共产党争江山，决雌雄。
毛主任看过报纸不禁夸奖黎征农做得不错，尤其是最后一句写得不错，这时便埋下了反间之计。建勋看过报纸不禁指责国民学太无耻了，因为小兰救郑云帆不是为了国民党效劳，是为了抗日统一战线。老刘说党组织一定不会轻信的，同时他猜测郑云帆可能真的没有死。胡先生去诗影那里问起郑云帆的情况，这时诗影的弟弟走了过来，谈起了自己的理想。这时黎征农来到了诗影家里，他给诗影带来了美国巧克力，可是小念却说自己喜欢吃桂花桃片。
黎征农向毛主任说起胡鑫铨每周都去郑云帆家里，毛主任质疑他是否知道郑云帆的身份?黎征农说起，胡鑫铨的秘书小兰是共产党，就算他不是共产党，也是通共人员。毛主任认为这个胡鑫铨是个隐患，黎征农提议将他干掉，毛主任却说不好办，同时他告诉黎征农，局里任定任命他为第二情报室的主任，而且让他打入渝州商报，做一个专栏记者，给自己披上红色外衣，发现线索，清除共党匪碟。
林虹正在学校排练的时候，黎征农推门而入，他告诉林虹，说自己是报社的记者，之后邀请她去喝咖啡。诗影跟男子在店里喝咖啡，当她从黎征农身边经过的时候，黎征农故意挡住了脸。林虹质问黎征农，那个女人是不是她太太?黎征农说出她是自己朋友的老婆，而跟她约会的男人不是自己的朋友。林虹准备起身离开，因为自己不跟有妇之夫来往，黎征农阻止。
